Vete a Edit,abre preferences y alli tienes las opciones del midi,en la ventana superior.
mod
En la configuración de Reason tienes que elegir el puerto de entrada MIDI que corresponda, Reason por defecto no activa ningun puerto MIDI.
¿No lo estás usando en ReWire, cierto?
Porque sí es así, la configuración la debes hacer desde el programa principal, ya que Reason estaría esclavizado.
Apunte curioso.El macho midi in va al out del controlador.Lo digo porque esto es bastante gracioso y puedes acabar en un psiquiatrico de no saberlo.