En mi caso, o por mi manera de trabajar, prefiero tener todo en una única carpeta enorme. Comparto muchos trozos de sonido entre diferentes proyectos (que en realidad son diferentes revisiones de un mismo tema) y supongo que sería bastante pesado -y costoso en espacio de disco- tener replicado todo el audio en cada proyecto.
Supongo que ése es el motivo por el que Cakewalk trae esta "feature" inhabilitada.
El caso es que en su momento a mí también me hizo falta un truco como el de Danisero, que veo que ha entrado con ganas al foro. ¡Bienvenido!