Es difícil saber el problema que puedes tener. Con Ctrl+Mays+M creas multisilencios, pero si en alguno de esos pentagramas tienes insertado un salto de línea, entonces no los agrupará en 1 sino en 2 o más. (hasta el salto de línea y del salto de línea en adelante) Revisa a ver si tienes un salto de línea que te divide los silencios o alguna otra opción de maquetación.
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Gracias ya está solucionado, alguna cosa de maquetación debia tener insertada, borre los compases y los volví a crear y ahora me los agrupa perfectamente.
Muchas gracias...