Anetes de todo eso yo recomiendo cambiarle las cuerdas.
Entonces si no te escapas de una buena calibrada... equipate con una bonita llave allen o hablale a tu Luthier de confianza!!!
Pero ya hablando en serio si tu armónico en el 12vo traste no suena igual que la cuerda pisada, es que está completamente desentonada.
La afinación y el ajuste de la cuerda de la guitarra depende de la longitud y de la tensión. Para ajustarla, a igual tensión, debes variar la longitud, que es lo que haces ajustando con la llave allen. En cada cuerda, afinas al aire, y luego pruebas si tiene la misma afinación en el traste 12, si no, debes variar la longitud, probando milímetros más corta o milímetros más larga, pero es ir probando.
Pillarle el punto exacto, es decir que esté exactamente en el mismo tono al aire y en el traste 12 es complicado, quizás imposible, pero, no es necesario, el ajuste es válido sin tanta exactitud, pero claro el margen de error también ha de ser mínimo. Ningún luthier lo hará perfecto, porque realmente esto es imposible, pero como digo, un buen ajuste, lo hace inapreciable al oído.
Claro, que el mastil y colocación de los trastes han de ser correctos, y esto será así si la guitarra es más o menos decente.
Date cuenta, que el mirar el ajuste al aire y en el traste 12 es sólo una manera, pues el mástil de la guitarra está diseñado para dar la misma nota en esos punto, pero cada traste tiene su propio tono, porque en el traste 11, el 5, el 21, etc, cada traste debe tener su tono, y se podría ajustar en cada traste, pero todos tendrán un mínimo de desajuste, pero como digo si el ajuste es correcto, el oído no lo nota, además la música tampoco es perfecta y muchas veces estas "imperfecciones" enriquecen la musicalidad.
Si te puedes permitir el luthier adelante, seguro que te mira muchas cosas más que son importantes, como calibar el alma de la guitarra.
Subir o bajar el puente, lo que hace en el ajuste es que varía la longitud de la cuerda en la dirección paralela al mástil, es eso que estudiamos en la escuela de los senos y los cosenos, lo uqe lo desajusta la guitarra.
Un puente bajo, lo que se dice una acción baja, puede producir trasteos, y un puente alto puede ser menos cómodo. Has de buscar la manerasque ma´s te guste, date cuenta que aunque trastee algo, no se oye en el amplificador y puedes tener la acción más baja si te resulta más cómodo.
Suerte!!
Veo que lo que yo decía tampoco estaba tan desacertado enconces ^^jejeje