Hooolaquetal!!!
Si es una caja de poca potencia, digamos 10-25w, puedes poner toda la electrónica dentro de la misma caja, en estas páginas puedes ver algunos ejemplos:
https://www.forosdeelectronica.com/threads/fotos-de-bafles-hechos-en-casa.6031/
https://www.forosdeelectronica.com/threads/fotos-de-amplificadores-hechos-en-casa.13123/
También hay una cantidad enorme de información, esquemas, etc....
Si, por el contrario, estás pensando en algo más potente, hay que poder la electrónica en una caja aparte. Esto es, se hace una división en el interior de la caja, separando lo que es la caja acústica del recinto con la electrónica.
Las vibraciones de un altavoz potente pueden dañar los circuitos, ya que casi siempre hay algunos componentes voluminosos, que son los más propensos a vibrar.
En las cajas comerciales todo se monta sobre una chapa que a la vez hace de disipador y cierra la caja por detrás.
Saludos!!!!