Por lo que dices parece que tienes bien asignadas las entradas Midi en Reason, ya que comentas que si que eres capaz de mover las ruedas de los distintos modulos de Reason.
La razon puede ser que aunque puedas controlar varios modulos de Reason a la vez (haciendo uso de los 4 buses y seleccionando en el modulo hardware distintos modulos de reason para cada canal), solo podras grabar en el secuenciador para el canal que tengas seleccionada la entrada midi (simbolo midi a la izquierda de la pista en el secuenciador).
Por el resto de pistas Reason recibira señales midi, pero no las grabara en el secuenciador.
Mira a ver si es por eso por lo que no grabas.
Recuerda que hay modulos en Reason para los cuales no se les crea automaticamente una pista en el secuenciador (como el mixer), y que lo tendras que hacer a mano.
Y tambien por si acaso compureba que en el menu de options tienes seleccionada la casilla de Enable Midi Remote Mapping.
Por cierto, ya que solo podras grabar informacion a una sola pista cada vez. Igual te resulta mas sencillo no utilizar los buses ni los distintos canales para los modulos reason, si no seleccionar la entrada de datos midi de la Rm1x desde el menu avanzado de Midi como en Edit/Preferences/Midi Advanced y en el cuadro de Remote control.
No se si te he resuelto algo o te he liado mas...