Más que el uso de plugins, lo que tenías que mirar es la composición del tema. Hacer variaciones a esa melodía manteniendo la esencia. Yo, por ejemplo, suelo hacer una melodía siguiendo las notas de la escala y así me hago con dos compases para la melodía; pero luego le hago una pequeña variación en las últimas notas, eso sí, manteniendo la esencia de la misma sin salirme de la escala usada. Y, en lugar de tener dos compases con una melodía repetitiva, ya tengo cuatro, por lo que será menos repetitivo y aburrido.
También puedes jugar con la duración de las notas, hacer que esa melodía empiece por la última nota y siga hacia atrás, trasponerla a otra octava para que suene más aguda o más grave, eso en cuanto a composición (tampoco entiendo mucho de esto).
Otra cosa que puedes hacer es cambiar el sonido utilizado para la melodía, si tienes un violín sonando en la primera estrofa; en la segunda métele un piano y se te hará menos repetitivo.
Eso es todo en lo que te puedo ayudar, espero que te sirva.
SAludos.
como te comenta Sa, puedes hacer variaciones a la melodía, cambiar el efecto en distintas partes, apoyarla con otro efecto en partes de la melodía, ósea hay muchas formas de hacerlo, mientras tu crees la melodía, si la melodía viene en un loop sample, lo mas que podrás hacer es acompañar el loop con otros elementos, loops o intercambiar loops de "melodías" entre las partes de la canción, meterle algún plugin de efectos delay, chorus, flanger, para que se escuche diferente.