El Rewire no funcionaba bien con las primeras versiones de Cubase VST 32. Tendrás que actualizarte hasta la R4 (creo que en esa ya funciona bien).
Por cierto: ¿qué versión de Reason tienes?.
Este es un tema del que se ha hablado mucho en este foro (probablemente del que más se ha hablado).
Lee alguno de los hilos anteriores, pero como resumen comentar que el motor de audio que se utiliza es el de Cubase, y no el de Reason. Se suponte que dicho motor es de mayor calidad.
Lo más conveniente (y algo más lioso) es mezclar desde cubase todas las pistas llevandolas por el midi device una a una y no la mezcla.
Además es la forma más sencilla de trabajar con Reason y con Audio o con instrumentos VST.