Tienes dos opciones, o dejas de usar el monitoreo directo, o apagas el monitoreo desde Cubase, que lo encuentras en el ícono en forma de bocina junto al botón de grabar en la pista en donde vas a grabar.
El monitoreo directo no es tan importante como crees. Si tienes un ordenador razonablemente bueno y además bajas el buffer del controlador (ASIO en el caso de Windows), no vas a tener problemas de latencia o de cortes al momento de grabar, y menos si hablamos de grabar una sola pista a la vez.
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Gracias por la respuesta Dogbert! Aún desactivando el monitoreo de Cubase (o por lo menos ese con dibujo de parlante en la pista) se escucha doble, creo yo que tengo una pc decente ya que fue armada para el proposito de minimamente grabar de manera casera (I5 7400,8gb de ram) pero aun bajando el buffer la latencia es pequeña pero molesta, por eso el monitoreo directo me seria funcional.
Mutea el track con ello dejaras de escuchar doble y unicamente la monitorizaciòn directa de la interfaz, el mute solo sirve para reproducciòn ya que afecta la salida de señal, no para grabaciòn ya que aquì estas utilizando entrada de señal que es la que se registra en el track.