Se me ocurren dos posibles problemas.
1. Que no hayas definido suficientes rodajas en el archivo.
2. Que no hayas acertado con el tempo original del archivo.
Para resolver el primer problema aumenta la sensibilidad. Si el fichero es demasiado largo y sobrepasas en número de cortes soportados por Reason (no por Recycle), divídelo en varios ficheros.
Para el segundo caso es fácil que no hayas acertado con el número de compases (bars) o de partes (beats) de tu loop, de manera que el tempo que interpreta Recycle no se corresponde con el tempo real del sample. Este tempo no tiene porque tener nada que ver con el tempo de Reason.
Como conclusión has de saber exactamente el tempo de tu loop a trocear, y has de conseguir que Recycle te detecte ese tempo. Para ir modificando el tempo prueba a ajustar correctamente los compases y las partes, en caso de que no estuvieran bien definidos.
A medida que aumentes los compases o las partes (partes de compás), el tempo detectado por Recycle irá aumentando.
El tema de configurar bien tanto los cortes, como el número de compases y de partes del sonido es capital en Recycle. De hecho es lo único que se hace en Recycle.
Por último comentar que Recycle no es la única opción para crear y/o manipular archivos .rex.
Desde mi punto de vista es mucho más potente el Zero-X Beat Creator. Aunque también es un poco más complejo.
Tiene más opciones, entre las que se encuentra la posibilidad de cuadrar el loop a un tempo determinado en caso de no estar bien cortado al 100% añadiendo o quitando un poco a la última rodaja. Así evitaremos tener archivos con tempo 129,56 en Reason que no se ajusten al 130 que puede ser el tempo real del loop. Es solo un ejemplo, pero el Zero-X es un buen editor de samples.
Echadle un vistazo:
http://www.beatcreator.com/documents/24.html