Pues la razón de porque pasa no te la tengo, pero la una posible alternativa a moverlas "a ojo" sería entrando al editor midi, y en el menu edit darle a "select all events" y después darle a la tecla "Q" o en el menu edit aparece quantize, y una flecha hacia el lado que abre varias opciones de cuantización.
Un saludo
Apenas envie en post anterior, descubrí que en el menu editor hay un boton con una "Q" roja que permite cuantizar con una cantidad de opciones. Pon atención en que primero debes selecionar las notas cuatinzar, con la opcion de menu edit select all events
Un saludo
me corrijo, no tienes que tener selecionado todas las notas, el cuadro que te abre el botón "Q" te permite decidir que quieres cuantizar