La diferencia es que por MIDI solo grabas los datos MIDI, y de la otra forma grabas el audio. Infórmate de lo que es MIDI porque me da la sensación que confundes términos.
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Hola.
Por los jack sale el sonido analógico, así que eso es lo que grabarías, previamente convertido a sonido digital por la interfaz (para que pueda "estar" en el ordenador).
Por los conectores MIDI sólo va señal MIDI, que no es sonido. La señal MIDI controla generadores de sonido (sintetizadores, teclados, módulos de sonido, instrumentos virtuales en el ordenador = VST, etc.). Es información que le dice a esos generadores: genera esta nota, con esta duración, con este volumen, usando tu sonido x, etc. Pero, insisto: no es sonido.
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