La importancia del frame rate va más orientada a la reproducción del video desde el pro tools, si reproduces un video que va a 25 fps a 24 fps, tu visualización del video te va a hacer imposible una sincronización correcta para con ese video. Ya que aunque desde el pro tools parezca que todo está sincronizado "al frame", a la hora de exportar el audio y pegarlo al video, éste irá perdiendo sincronía paulatinamente.
Espero ser de ayuda.