Bueno, esos cc son para controlar los niveles de envio hacia MFX1 y MFX2, los típicos envios a reverb y chorus pero en relación al sonido interno o la salida de un IFX hacia MFX1/2.
Tal vez se podria hacer si ese sonido que tu procesas, se insertase a través del motor de la expansión Radias, pero claro, esto ya es algo más específico.
Diria que para lo que necesitas debes controlar el nivel wet/dry de cada MFX por un cc asignable.
Entra en las páginas de edición de parámetros de efectos de cada MFX y allí veras que el último parámetro es el nivel Wet/Dry. Al lado en "Src:", podrás asignar un controlador para ese nivel, elije el que te vaya bien tanto en el M3 como el Fatar.
No solo puedes usar ccs si no control de otros tipos, Korg lo llama "Dynamic Modulation Sources" o Dmod. El listado de estos controladores, así como algunas explicaciones está en la guia de parámetros, en "Appendices".
Por comodidad, usa el M3 en modo Program, en tal caso solo se utiliza un canal, el determinado en Global. Si este es por ejemplo el 1, todo el control sobre efectos se hace sobre ese canal.
Supongo que en calidad de los algoritmos, el Lexicon pero en flexibilidad igual el del M3... no?