Con Reason 10 es muy fácil
hay un player que se llama CV Player Tap
tan solo hay que conectar las salidas note y gate del step sequencer de thor a su primer input
y darle al botón send to track
https://shop.propellerheads.se/rack-extension/cv-player-tap/
Pero creo que tu tienes Reason 5, no?
ahí me parece que no hay opción de pasar las notas al secuenciador.
lo que si puedes hacer es programar en Thor que la nota que toques desde el secuenciador o desde el teclado, dispare el secuenciador de thor, e incluso que cambie el tono según la nota que toques.
para que dispare la nota
Source -> voice key/Gate
Dest -> Step Sequencer/Trig
para que cambie la altura tonal de la secuencia según la nota del teclado
Source -> voice key/Note (full range)
Dest -> Step Sequencer/Transpose