¿Para pinchar? A no ser que pinches con video de alta definición, cualquiera de las dos conexiones tiene velocidad de transmisión de datos más que suficiente como para que jamás tengas un problema. Thunderbolt es mucho más rápido pero, ¿te merece la pena pagar la diferencia de precio? Eso solo lo sabe tu bolsillo.
Para pinchar yo tendría en cuenta otros factores:
- Si vas a salir por ahí a pinchar quizá un disco duro "rugged", o con acolchamiento exterior, te puede convenir más, para resistir golpes.
- Los SSD son muchísimo más caros (vuelve a consultar a tu bolsillo) pero a cambio se calientan menos y no tienen partes mecánicas, algo que los hace más resistentes de cara a llevártelos por ahí. Y sí, son aún más rápidos.