Los guarda por defecto en una carpeta en el directorio del proyecto con el mismo nombre (Freeze Files), pero puedes pasar de ellos, no hace falta cambiar su ubicación ni nada, los generará cuando sea necesario (como en el caso de los Fade Files).
Ya, pero lo que me interesa es que los guarde en un disco externo, aunque el proyecto esté en el disco del portatil (que es pequeño y se llena rápido), cuestión de espacio. Además, juraría que he visto a alguien hacerlo o alguien me lo ha explicado...