Para manejarte con Reason y cubase tienes que tener en cuenta que los modulos de reason no aparecerá en pistas del cubase como un VSTi, seguirán apareciendo en el rack de Reason.
Lo que tienes que hacer es establecer comunicación entre Reason y Cubase de dos formas.
1.- Conectar la salida de audio de los modulos de Reason al mixer de Cubase, esto sería el paso que has hecho al activar Mix Ly Mix R y los canales que tu necesites.
2.- Conectar las pistas midi de Cubase a los modulos de Reason. Tienes que crear una pista midi y seleccionar como salida el modulo de Reason que quieras.
Ya podrás mandar datos desde Cubase a Reason, hacer que se generen notas y que el audio generado llegue al mixer de Cubase.
Te recomiendo que, si quieres usar los módulos de Reason por separado, elimines el/los mixer/s a los que están enganchados y los conectes a un canal Hardware Interface (el cacharro de arriba del todo). Después, como dice BAC, conectas una pista midi de Cubase a un módulo de Reason.