Bueno, asi de pronto se me ocurre que el problema pueda deberse a dos posibles causas.
1. Pudiera ser que alguno de los plugins que has instalado no se lleve del todo bien con el programa o con el PC, dentro del proyecto prueba a poner en bypass alguno de los plugins que estes utilizando, haz esto mismo con cada uno de ellos, se trata de ir descartando para comprobar si el conflicto esta ahi, en alguno de esos plugins, si al desactivar alguno de ellos todo empieza a funcionar correctamente, habras localizado al culpable
2. Quizas estes exigiendole demasiado a la CPU de tu ordenador, habria que saber las especificaciones de tu maquina, sobre todo CPU y cantidad de memoria RAM de la que dispones, descarto disco duro porque como mencionas tan solo estas usando dos pistas de audio, de modo que el disco duro apenas esta trabajando.
Dices que estas trabajando con 8 pistas midi, ¿quiere decir eso que tienes 8 VSTi trabajando a tiempo real en ese proyecto? Si es asi y los plugins son de los que "pesan", estarias sometiendo a tu PC a una carga importante, comprueba en el medidor de CPU de Samplitude el consumo que esta teniendo el programa, si mantiene mas o menos un nivel regular (ya sea alto o bajo) o si sube de manera significativa cuando empieza a procesar alguna pista en concreto...todas esas cosas.
Si le estas pidiendo demasiado a tu maquina tienes soluciones para paliar en la medida de lo posible el problema, como subir el buffer de tu tarjeta de sonido, pasar a audio esas pistas midi (o al menos las que consideres mas problematicas), una vez hecho esto deberas poner en bypass los instrumentos virtuales que tuvieras en ellas, tambien puedes recurrir al socorrido "freeze" en la pista o pistas que desees.
Un saludo.