a ver 1ero para encontrar el vsti de guitarra virtual sera algo dificil, yo probe muchos y ninguno me convencio por lo que termine desistiendo, el unico que me falto probar y siempre quise fue el prominy que por cierto javi_metal los programa muy bien junto al guitar rig 3. Bueno llegando al punto en que te convenza uno te paso a explicar como lo harias funcionar en el cubase, la verdad ahorita no tenga ningun vsti de guitarra virtual en la pc pero t dire mas o menos como recuerdo que lo hacia:
1ero entras al cubase aprietas F11 y ahi insertas el VSTI, en tu caso el virtual guitarist, luego en la pista Midi le das como salida este.
2do creas una pista de efectos, ahi haces click en su boton e y en inserciones escoges el amplitube en tu caso, abres el plugin y cargas el preset que desees.
3ero debes tener una especie de pista del virtual guitarist que se te creo al escogerlo como vsti a usar, buscas y entras en sus opciones y en envios buscas donde te salga amplitube, asi estas enviando la señal que sale del virtual guitarist a la entrada del amplitube. Espero que te salga de esa manera, es mas o menos lo que recuerdo.
Luego veras que necesitaras "humanizar" tus archivos midi de guitarra pues suenan muy MIDI, recuerdas que al tocar un acorde por ejemplo no todas las cuerdas suenan con la misma intensidad, ni tampoco todo debe sonar muy a tiempo pues el ser humano no toca asi. Para esto ya podrias pedirle consejos a javi_metal que como t comente es muy bueno secuenciando guitarras, y cuando te pase los consejos me los pasas a mi tambien
suerte