si te faltan sonidos al hacer un loop puede ser debido a que la nota está ligeramente antes del inicio del compas.
prueba a seleccionar las notas que eches de menos, o todas las del comienzo del compas y cuantizalas al 100% para que queden justo en la linea de comienzo de compas.
en cuanto a como hacerlo con el ableton... no tengo ni idea de ableton, se que puedes conectarle Reason a través de ReWire, pero no se cuales son los trucos de ese programa, creo que sería mejor que preguntaras esa parte en el foro de ableton.