Buenas, hasta el mes que viene no tendre este sinte, pero lo poco he leido de este creo que te puede ayudar, aunque no se si te sera lo que estas buscando.
Antes de todo, mas o menos entiendo lo que quieres decir, pero no me queda del todo claro, no se si quieres alagar en sentido de tiempo que las notas se han más largas o que que el secuanciador siga leyendo despues de la primera linea.
Si es la primera opcion, lo que estas buscando es el MIDI Divice, que te permite elegir el tipo de nota: negras, corcheras, etc...
Si es la segunda opcion: En principio al finalizar la primera linea en el step 16, si la linea esta llena, tienes que ponerle envez de una nota el parametro reset, "rst" Entoces te deja escribir en la segundo linea.
Aunque ya te dijo no te lo estoy diciendo a ciencia cierta, hasta el mes que viene poco más te podre ser de ayuda.