Hola Caraguia,
Si quieres masterizar ese audio, no te queda mas remedio que pasarlo al ordenador.
Lo ideal desde luego es que encontrarás un minidisc con salida digital.
Una vez que se está en digital lo ideal es permanecer en el si no se tiene unos muy buenos convertidores y un muy buen reloj.
No obstante si lo pasas al ordenador lo mejor es que lo pases por la entrada de linea si es que la tiene y si es que salta el previo. A menos que tu consideres que el previo de micro le puede agregar algo. Ten en cuenta que los previos siempre le dan un color al audio, sobre todo si es una mezcla en la cual tienes muchos instrumentos y por lo tanto un espectro de frecuencia y dinámicas muy variados.
Es importante que sepas cual es el formato final de ese audio y el formato en el que está en el minidisc. Así evitas conversiones innecesarias. Recuerda que el audio habitual para cd y mp3 es 16bits 44.1khz.
Normalizar no es lo mas recomendable si quieres subir el volumen.
Es un proceso que altera demasiado la dinámica del audio. Para eso utiliza un buen limitador con un algoritmo de limitación mas natural que el proceso de normalización.
Ya que trabajas con protoolo, te recomiendo los plugins de "Massey", son muy buenos y baratos, además te puedes bajar demos y probarlos.
Trata de utlizar plugins que sean respetuosos con el audio, es decir que sean muy transparentes. Es lo que se suele hacer en música clásica, pero eso ya sabes que es muy relativo. Si pones un plugin y te gusta, pues está bien y ya está.
De eq te recomiendo el eq digital de Brainworx, es muy bueno.
Un saludo y suerte