Si desinstalas la tarjeta anterior Nuendo tomará la tarjeta nueva. Configura bien las opciones de tu tarjeta en la pestaña Configuraciones(valga la redundancia).
eso ya lo tengo hecho ,pero me sigue abriendo los bus de entrada y salida antiguos , de todas formas ya se como hacerlo ,por si a alguien le interesa ,en vst conexiones cambias los bus de entrada y salida como kieras
un saludo