Bueno.. despues de seguir sin entender el tema, deciros que se ha solucionado solo a medias. Cuando grabo 5 o 6 pistas a la siguiente pista que grabo via midi, esta se descuadra a la hora de escucharla (que no al grabarla)... pues bien... borrando esa pista, cerrando el cubase y volviendolo a abrir se soluciona la cosa... hasta las 6 o 7 pistas despues... (hablo solo a la hora de grabar midi) con audio va perfecto. Así que no se, es un poco coñazo... pero bueno... Por lo menos cerrando y abriendo el programa cuando pasa el problema se soluciona. Ya paso de buscarle explicación porque no se la encuentro.
De todas formas, muchisimas gracias por las ayudas.
Comprueba la conexión del controlador o que éste funcione bien en otro equipo, si no está bien hace cosas inesperadas. Es que me ha pasado algo parecido aunque con otra tarjeta.