si es equipo hardware es analógico y da igual la frecuencia que esté el audio, primero habrá que convertirla de digital a analógico y luego al revés. En caso de que te refieras a equipos digitales ya es distinto, muchos solo funcionaban a 44.1 o 48 khz, entonces si podría haber incompatibilidades, habría que esta convirtiendo frecuencias de muestreo.