Me suena a que JACK no está funcionando, y lo que suena es por PULSEAUDIO (el vídeo es desde Firefox o así?)
Gracias por responder. Si, por videos me referia a Youtube desde Chrome. ¿Se te ocurre el motivo por el que no funcione?
Respecto a la reproduccion de flash player plugin (youtube y demas) y cualquier programa que no soporte jack
instala pavucontrol ( El "mezclador" de pulse) y el modulo jack para pulseaudio (pulse-jack-module o algo así).
Respecto a los sintes debes configurarlos desde sus menus repectivos para que usen jack en vez de alsa o pulseaudio.
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Perfecto, parece que se ha solucionado. Muchas gracias monon!