...creo que nos estamos liando. Por partes:
...cualquier reproductor de Cd puede ser usado con los CDs time-codes, independientemente de la mesa que se use, basta tener también una tarjeta de audio "compatible" para ello (A6, A8, A10...etc). y los Cds "timecodes".
...que tengas una DJM-900 Nexus "Traktor Certified" quiere decir que TAMBIÉN puedes usar la mesa como tarjeta de sonido para los decks y puedes conectar cualquier reproductor sin tarjeta de audio y usarlo en modo "timecode" con los Cds de Traktor igualmente.
...también, hay reproductores de Cd que llevan tarjeta de audio interna y son midi, con lo que puedes usarlos con su mapeo correspondiente en modo HID, independientemente de la marca.
...en cuanto a Pioneer y a sus modelos de CDJ, todos irán bien con los Cds "time code". Dependiendo del modelo, podrás usar Traktor también en modo HID, pero hay unos modelos que dan problemas y otros que van perfectos.
...modelos de CDJ que van finos en modo HID: 400, 900, 2000
...modelos de CDJ que dan problemas y no van tan finos: 350, 850
...con los modelos más antiguos (100, 200, 800, 800 Mk2) no puedes usar Traktor en modo HID, pero sí con timecodes.
...el conexionado para manejar Traktor en modo HID es fácil: los RCA de audio directamente a los canales de la mesa como cualquier reproductor. Y el cable USB de cada CDJ, al ordenador.
...primero se encienden los CDJ y después se abre Traktor.
...seleccionas el modo "PC" en cada CDJ y seleccionas el Deck 1 y el Deck 2 en ambos reproductores.
...también deberás observar que Traktor te los ha reconocido y en preferencias debes de configurarlos empezando por el audio y seleccionando los 2 CDJ. Dependiendo de si usas Windows (PC) ó OX (Mac) también te puede surgir el problema de que sólo Traktor te reconozca una unidad teniendo conectada las dos. Entonces te hará falta (en Mac) un parche llamado "CDJ Agregator" y en la configuración del Mac de su audio midi, configurarlos como predeterminados para que Traktor sepa "separarlos" y puedas usar los 4 canales de los 2 reproductores (L1+R1 y L2+R2).
...además, de la página de Pioneer, puedes descargarte los ficheros ".tsi" que son los mapeos del modelo correspondiente que uses, para que sus funciones principales en los reproductores, coincidan con el manejo de Traktor.
...deberás importarlos en la pestaña del control manager, dentro de las preferencias de Traktor.
...volviendo al principio de tu pregunta, personalmente me parece exagerado comprar una DJM-900 Nexus para manejar de este modo Traktor con 2 CDJ. Hay otras opciones más baratas y mejores para manejar Traktor con más fiabilidad.