Hola,
primero quizás esta pregunta la deberias hacer en el foro de masterin.
Y bueno, por lo que me ha pareceido entender, pones el stero expander al final de la cadena. Si es así, lo debes poner antes, lo último de lo último debe ser el limitador y dither.
suerte
Que no te marque clip en ninguna de las frecuencias de un analizador de frecuencias no significa que en la suma de todas ellas no te tenga que clipar... es como si tienes 4 canales en una mesa sonando sin clipar y en la salida master, al sumarlos todos a 0 dBs, te clipee. Prueba a bajar el nivel de la entrada del analizador.
En cuanto al estereo expander, no se cual usas, pero supongo que será uno de esos plugins que jugara con las fases de los 2 canales estereo, y al hacer eso, modifica las sumas.. no se, todo esto son conjeturas.