yo llevo varios años pasando mis wavs a mp3 y viceversa con un programa llamado mpeg suite.
no se si es el mejor, pero me resulta muy comodo, practico, rapido y sencillo. ademas es gratuito.
http://ec2000.xperiment.net/index.php?id=software
aqui lo encontraras para descargar.
su funcionamiento es sencillo. el programa tiene un par de pestañas.
una es "wav 2 mp3" otra "mp3 2 mp3" y otra "mp3 2 wav" y luego está la de las opciones.
las tres primeras sirven para convertir archivos, simplemente buscalos en el explorador de la izquierda y pasalos al de la derecha y pulsa el boton convertir.
en las opciones puedes elegir unos 3 conversores diferentes. yo suelo usar el blade enc que me deja elegir muchos bitrates. y bueno, si sabes un minimo de ingles el resto de las opciones ya las entenderás. cosas como destino de los archivos convertidos, eliminar los originales, crear convertidos en la misma carpeta de los originales...
suerte!