Hola Thoro
Se supone que la automatización es una función que consiste basicamente en sustituir "las manos por un robot" por eso es que el daw no permite contradicciones como la que mencionas, es decir, automatizar el volumen para luego decirle que no automatice, no sé si me explico bien.
Quiero decir que si a un track le das orden de automatización de volumen el track obedece esa orden, pero si lo que quieres es corregir la automatización lo que tienes que hacer es por ejemplo reescribir la automatización (en el Cubase no se como es, yo utilizo el Reaper)
Aunque no entiendo bien para que quieres hacer eso de automatizar para luego cambiar el parámetro general del volumen, en tu caso lo que yo haría sería enviar la señal de ese track a otro track en lugar de al master y usar este último como modulador general de volumen. Pero como te digo no le veo la utilidad a eso que quieres hacer. Para eso que quieres hacer basta con que en la automatización coloques el volumen en el punto que quieres y que se mantenga en ese punto y ya está.
Un saludo