Así es, de ley desde el preamp hacia la Focusrite con jack - jack, si no si mandas por XLR y sin querer pulsas el phantom power va 48V hacia la salida N3 de fase invertida de tu preamp y "adios, muchachos". En la Focusrite el selector "line - inst" lo pones en "line" y puedes pulsar el boton "pad" en caso de tener una señal bastante fuerte. Y ya la salida de Focusrite depende de tus monitores - si tienen entrada balanceada te armas dos cables con TRS (jack estéreo) y si no - con TS mono.
Y esto si vas a utilizar el inversor de fase en alguno de los canales depende que técnica de microfoneo vas a usar si haces una grabación estéreo con 2 micrófonos.
Sobre el pad de 80Hz no creo que lo necesitas, porque los graves de una guitarra van mas allá y puedes castrar las notas mas graves.