La verdad es que MASTERIZAR, aunque suene un poco obvio, se trata de "hacer un master", lo cual no es otra cosa que un prototipo para replicación. "Prototipo" es un modelo ejemplo, lo que es un producto terminado. Por supuesto, el orden de las canciones es fundamental en el proceso y en el medio lo conocemos como "secuenciado".
Es más, normalmente es lo primero que uno hace para un álbum, ya que es importante analizar cómo se comporta el final de una canción con el inicio de otra, lo que lo lleva a uno al tiempo de silencio. No hay un estándar, es cierto, pero sí es necesario que el álbum lo tenga, para que no pierda sentido de la forma.
En general es el productor o la banda quienes tienen claro éste orden, pero también es buena idea dejarse aconsejar un poco. Un truco que funciona bien para ésto es pensar en el álbum como si fuera una presentación en vivo; así se ubican los temas en el orden que mejor funcionen desde el punto de vista sicológico. Una opción popular es arrancar el álbum "arriba", con una canción fuerte, e ir bajando paulatinamente la intensidad, para volver a subirla luego y terminar de nuevo "arriba", para despedirse.
Hay productores que agrupan canciones por afinidad y así se divide en álbum en "actos", dejando un espacio de silencio sutilmente más largo entre los temas "límite". Con éste tema del secuenciado se puede experimentar mucho con los temas aún sin procesar; si se quiere hacer un "previo" de secuenciado y se ha llegado a un resultado satisfactorio de ésta manera, siempre se puede enviar un EDL al estudio de mastering, para usarlo como punto de partida.
Espero que ésta información sea de utilidad