No pasa nada (supongo que tiene una salida de línea). El microfonearlo es mejor si dispones de un micro decente, pero no por una cuestión técnica de averiar no un aparato, sino porque es más fácil conseguir un buen sonido en la grabación. Justo al contrario que con un bajo, que es mucho más sencillo sacar un buen tono a través de la salida de línea del ampli (o una caja de inyección) en grabaciones caseras e incluso profesionales.
Hace poco estuve en estudio y grabamos las tomas por linea y sonaba muy bien, aunque luego, para la mezcla definitiva, esas tomas se amplificaron a través de un ampli de bajo para hacer la toma definitiva con micros. Yo no sabía que se hacía así (anteriormente nunca lo había hecho así), pero por lo visto es bastante habitual.