Hola, Rock_4. Que to sepa, para hacer esos cambios es questión de ir a "guardar como" y elegir otro formato de entre las opciones que CE te da.
Bueno, tienes una opcion que es el batch procesing o procesos batch. Cuando le das a esa opcion se abre un dialogo en el cual vas eligiendo la acciones que quieres tomar sobre varios archivos a la vez. Primero eiges los archivos (Todos los que quieras) y luego los convierte al formato que quieras con la calidad que quieras y por ultimo y muy importante tienes que elegir entre crear una copia de los archivos en la mism u otra carpeta o sustituir los archivos viejos por los transformados. Ten cuidado por que me ha pasado, muy pocas, pocas veces, que alguna conversion no ha sido correcta y me ha desaparecido el fichero.
Bueno, espero haberte ayudado.
Un saludo