Es que no tienen nada que ver. Uno es teclado y el otro módulo, uno es analógico y el otro V.A., uno tiene bastantes knobs y sliders y el otro no, uno es polifónico y el otro no, uno es ameno para principiantes y el otro no tanto.
Depende de lo que quieras hacer con él. Obviamente, si necesitas pads, cuerdas y otros sonidos polifónicos, no tienes elección, tendrá que ser el Gaia (siempre que no consideres otros modelos, que para mí los hay mejores).
Como sinte, aún con sus limitaciones, me parece mejor el Mopho, siempre que puedas pasar sin teclas, sin polifonía y con un sistema de edición algo engorroso (hay editores disponibles que supongo que facilitan la tarea).