Hola.
Si estamos hablando solo de formatos (que en ningún momento esto determinará el tipo de sistema en el que deberás oir tu música al pasarla a un CD, ni su número de canales)... lo ideal es guardar y conservar los archivos en el formato de más calidad que te permita tu equipo. Por ejemplo; Archivos Wav / 24 bits / 48Khz sería el estandar profesional actual. Despues pásalos a Cd con un programa como Nero. Pero repito, el formato en el que guardas el archivo de audio no tiene absolutamente nada que ver con el número de canales de audio que éste contiene...
Un saludo.
Si quieres grabar en un CD de música (de esos en los que solo te caben 74min) entonces no tienes manera. El SACD me parece que tenía posibilidad al igual que los DVD de música (sí, eso existe).
Por el otro lado, creo que la manera más fácil de guardarlo sin complicarse es en un avi. Este formato admite varias pistas de sonido que formen un surround. Otra posibilidad es el formato ac3.
Saludos
Merlin