no uso pro tools pero las cosas que hacen sonar asi son:
El sample rate: si tienes o estas usando una pista a 44.1 e inicias sesión a 96 pasa algo parecido.
El tempo de la canción: Aunque eso debería afectar a la pista mas no a la voz.
Configuración: Si tu tarjeta de audio tiene mas de una entrada de mic, debes decirle al programa cuan quieres que grabe y luego de eso crear el track, osea debes rutear.
Espero algo de eso te sirva.