Lo dicho, puedes practicar aleatoriamente hasta dar con las notas que cuadren con el sample. Ese es un camino, hay otros en principio más complejos pero a la larga más gratificantes, por ejemplo, aprender teoría musical: escalas, armonía, etc. El límite será el que tú te impongas.
A todo esto ¿Qué material contiene el sample? ¿Es una canción completa? ¿Es un fragmento de guitarra? ¿Qué es? ¿Tocas ese plugin de bajo con un teclado? Para que te hagas una idea de la dimensión del problema supongamos que tienes un teclado activando un plugin de bajo y el sample contiene una guitarra en el que durante 4 compases toca la misma nota, por ejemplo DO, o el mismo acorde, por ejemplo DO mayor:
una similitud, imagina lo que puedes dibujar partiendo de un punto en un papel (dos dimensiones). El que ese punto sea una recta, un círculo u otra figura dependerá de los demás puntos. Si sólo te dan otro punto más podrías dibujar una recta, por ejemplo, y si te dan un conjunto de puntos equidistantes (de igual distancia) a otro que llamamos centro será un circulo. Trasladando este ejemplo al de tu fragmento de guitarra en DO te diré que sobre el teclado podrás tocar (dibujar) cualquier tecla blanca que no sonará mal porque estás tocando la escala natural de DO, pero como partimos de una nota (punto en un papel), igualmente podrías tocar (dibujar) otras escalas (figuras) que tampoco sonarían mal, pero eso va a depender de qué se toque (puntos se dibujen) después de ese DO ¿me sigues?
Bueno, pues si sigues el camino de la teoría musical ya te adelanto que un post en un foro no es lo que más te conviene para aprenderla, tú decides.
Saluti, respecto al tema de aprender escalas, harmonía... la verdad que estoy interesado en ese aspecto, puesto que produzco musica electrónica y hasta ahora siempre he sacado melodías, acompañamientos, bajos y demás a oído, nota por nota, y probando. Pero me gustaría aprenderlo para saber el porqué es así, porqué esta nota va aquí y aquí, qué nota va, etc...
Como son uan serie de conocimientos tan extensos y amplios, no sé por donde empezar, podrías aconsejarme y darme un punto de partida?
Gracias!
Cierto, hay gente que nace con oído absoluto y muere sin haberlo "cultivado". Lo normal entre músicos y no músicos es tener oído relativo, dicho burdamente: identificar notas en relación a (relativas a, comparadas con) otra/s nota/s. 
