Si tu DAW te permite trabajar en MP3, tu mismo. Ahora, estamos hablando de un formato comprimido que seguramente esté lejos de lo ideal.
Me queda la duda de si entiendes en qué consiste el proceso de mezcla y mastering.
1
Claro que se puede, aunque debido a su resolución va a ser más fácil crear problemas de fase y otros inconvenientes, según lo que vayas trabajar. Olvídate de muchas técnicas como procesados paralelos, por ejemplo, pero si.
Hasta cierto punto se puede moldear un poco eq y demás.
Posdata: Hablamos de un remaster, no creo que sobre una mezcla en mp3 saques un master comercialmente aceptable, a no ser que la mezcla venga prácticamente para no hacerle nada.